Н.А. Дидковский является автором более 200 публикаций в области терапии, гематологии, пульмонологии, иммунологии, генетики. Круг его научных интересов весьма широк — он впервые описал две неизвестных ранее в мире формы наследственных аномальных гемоглобинов, получивших в международном реестре наследственных гемоглобинопатий названия «гемоглобин Москва» и «гемоглобин Волга», им впервые в России диагностированы и описаны случаи таких наследственных форм гемолитических анемий как гемоглобинопатия Н, альфа- и дельта-талассемия. Также первым в нашей стране он диагностировал и описал клинические случаи селективного дефицита Ig А, эмфиземы легких обусловленной дефицитом альфа-1-антитрипсина, бронхоэктатической болезни, ассоциированная с общей вариабельной иммунной недостаточностью, случай первичной цилиарной дискинезии с нормальным расположением внутренних органов (вариант синдрома Картагенера), наследственный ангионевротический отек с нарушением функциональной активности С1-ингибитора. Н.А.Дидковский является ведущим в стране специалистом, внесшим большой вклад в проблему разработки методов диагностики и лечения аспириновой формы бронхиальной астмы.